Chronic rhinosinusitis (CRS) is a prevalent inflammatory condition affecting the paranasal sinuses, with a complex etiology involving genetic and environmental factors. This thesis aims to explore the interplay between genetic variations, specifically Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), and microbial diversity in the context of CRS to better understand disease prognosis. The study begins by reviewing the current literature on CRS, highlighting the existing knowledge gaps and the importance of considering both genetic and microbial factors in disease development and progression. Next, a comprehensive analysis of existing genomic databases and clinical cohorts is conducted to identify relevant SNPs associated with CRS susceptibility and severity. The impact of these SNPs on the immune response and mucosal barrier function is explored, shedding light on their contribution to CRS pathogenesis. Furthermore, the thesis investigates the microbial communities inhabiting the sinuses of CRS patients using advanced metagenomic sequencing techniques. The microbial diversity and composition are characterized, and potential associations between specific microbial species and disease prognosis are examined. Additionally, the influence of SNPs on the sinus microbiome is explored, aiming to identify potential gene-microbiome interactions that may influence disease outcomes. The findings of this study have the potential to enhance our understanding of the genetic and microbial contributions to CRS, paving the way for personalized approaches to disease management and targeted therapies. By unraveling the intricate relationship between SNPs, microbial diversity, and disease prognosis, this research has the potential to improve patient outcomes and quality of life for individuals suffering from CRS.

La sinusite cronica (CRS) è una condizione infiammatoria diffusa che colpisce i seni paranasali, con un'eziologia complessa che coinvolge fattori genetici ed ambientali. Questa tesi mira a esplorare l'interazione tra variazioni genetiche, in particolare i polimorfismi a singolo nucleotide (SNP), e la diversità microbica nel contesto della CRS al fine di comprendere meglio la prognosi della malattia. Lo studio inizia con una revisione della letteratura attuale sulla CRS, evidenziando le lacune conoscitive esistenti e l'importanza di considerare sia i fattori genetici che quelli microbici nello sviluppo e nella progressione della malattia. Successivamente, viene condotta un'analisi approfondita di database genomici esistenti e di coorti cliniche per identificare gli SNP rilevanti associati alla suscettibilità e alla gravità della CRS. Viene esaminato l'impatto di questi SNP sulla risposta immunitaria e sulla funzione di barriera mucosale, gettando luce sul loro contributo alla patogenesi della CRS. Inoltre, la tesi indaga sulle comunità microbiche che popolano i seni dei pazienti affetti da CRS utilizzando tecniche avanzate di sequenziamento metagenomico. Viene caratterizzata la diversità e la composizione microbica, e vengono esaminate le potenziali associazioni tra specie microbiche specifiche e la prognosi della malattia. Inoltre, viene esplorata l'influenza degli SNP sul microbioma dei seni, al fine di identificare possibili interazioni gene-microbioma che potrebbero influenzare l'evoluzione della malattia. I risultati di questo studio hanno il potenziale per migliorare la nostra comprensione dei contributi genetici e microbici alla CRS, aprendo la strada a approcci personalizzati nella gestione della malattia e a terapie mirate. Svelando l' intricata relazione tra SNP, diversità microbica e prognosi della malattia, questa ricerca potrebbe migliorare l'esito e la qualità della vita dei pazienti affetti da CRS.

Il paesaggio genetico e microbico della rinosinusite cronica. Rinosinusite cronica: studiare l'impatto dei polimorfismi a singolo polimorfismi a singolo nucleotide e sulla diversità del microbioma sulla prognosi della malattia / Maniaci, Antonino. - (2024 Feb 07).

Il paesaggio genetico e microbico della rinosinusite cronica. Rinosinusite cronica: studiare l'impatto dei polimorfismi a singolo polimorfismi a singolo nucleotide e sulla diversità del microbioma sulla prognosi della malattia

MANIACI, ANTONINO
2024-02-07

Abstract

Chronic rhinosinusitis (CRS) is a prevalent inflammatory condition affecting the paranasal sinuses, with a complex etiology involving genetic and environmental factors. This thesis aims to explore the interplay between genetic variations, specifically Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), and microbial diversity in the context of CRS to better understand disease prognosis. The study begins by reviewing the current literature on CRS, highlighting the existing knowledge gaps and the importance of considering both genetic and microbial factors in disease development and progression. Next, a comprehensive analysis of existing genomic databases and clinical cohorts is conducted to identify relevant SNPs associated with CRS susceptibility and severity. The impact of these SNPs on the immune response and mucosal barrier function is explored, shedding light on their contribution to CRS pathogenesis. Furthermore, the thesis investigates the microbial communities inhabiting the sinuses of CRS patients using advanced metagenomic sequencing techniques. The microbial diversity and composition are characterized, and potential associations between specific microbial species and disease prognosis are examined. Additionally, the influence of SNPs on the sinus microbiome is explored, aiming to identify potential gene-microbiome interactions that may influence disease outcomes. The findings of this study have the potential to enhance our understanding of the genetic and microbial contributions to CRS, paving the way for personalized approaches to disease management and targeted therapies. By unraveling the intricate relationship between SNPs, microbial diversity, and disease prognosis, this research has the potential to improve patient outcomes and quality of life for individuals suffering from CRS.
7-feb-2024
La sinusite cronica (CRS) è una condizione infiammatoria diffusa che colpisce i seni paranasali, con un'eziologia complessa che coinvolge fattori genetici ed ambientali. Questa tesi mira a esplorare l'interazione tra variazioni genetiche, in particolare i polimorfismi a singolo nucleotide (SNP), e la diversità microbica nel contesto della CRS al fine di comprendere meglio la prognosi della malattia. Lo studio inizia con una revisione della letteratura attuale sulla CRS, evidenziando le lacune conoscitive esistenti e l'importanza di considerare sia i fattori genetici che quelli microbici nello sviluppo e nella progressione della malattia. Successivamente, viene condotta un'analisi approfondita di database genomici esistenti e di coorti cliniche per identificare gli SNP rilevanti associati alla suscettibilità e alla gravità della CRS. Viene esaminato l'impatto di questi SNP sulla risposta immunitaria e sulla funzione di barriera mucosale, gettando luce sul loro contributo alla patogenesi della CRS. Inoltre, la tesi indaga sulle comunità microbiche che popolano i seni dei pazienti affetti da CRS utilizzando tecniche avanzate di sequenziamento metagenomico. Viene caratterizzata la diversità e la composizione microbica, e vengono esaminate le potenziali associazioni tra specie microbiche specifiche e la prognosi della malattia. Inoltre, viene esplorata l'influenza degli SNP sul microbioma dei seni, al fine di identificare possibili interazioni gene-microbioma che potrebbero influenzare l'evoluzione della malattia. I risultati di questo studio hanno il potenziale per migliorare la nostra comprensione dei contributi genetici e microbici alla CRS, aprendo la strada a approcci personalizzati nella gestione della malattia e a terapie mirate. Svelando l' intricata relazione tra SNP, diversità microbica e prognosi della malattia, questa ricerca potrebbe migliorare l'esito e la qualità della vita dei pazienti affetti da CRS.
SNP; CRS; Chronic sinusitis; Microbiome; S.Aureus; P. Aeruginosa
SNP; CRS; Rinosinusite cronica; Microbioma; S.Aureus; P. Aeruginosa
Il paesaggio genetico e microbico della rinosinusite cronica. Rinosinusite cronica: studiare l'impatto dei polimorfismi a singolo polimorfismi a singolo nucleotide e sulla diversità del microbioma sulla prognosi della malattia / Maniaci, Antonino. - (2024 Feb 07).
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.11769/597890
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