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An agent based modeling approach for the analysis of tuberculosis - Immune system dynamics 1-gen-2018 Pappalardo, Francesco; Russo, Giulia; Pennisi, Marzio; Sgroi, Giuseppe; Alessandro, Giuseppe; Palumbo, Parasiliti; Motta, Santo; Fichera, Epifanio file da validare
BIOESOnet: A Tool for the Generation of Personalized Human Metabolic Pathways from 23andMe Exome Data 1-gen-2018 Pennisi, Marzio; Forzano, Gabriele; Russo, Giulia; Tomasello, Barbara; Favetta, Marco; Renis, Marcella; Pappalardo, Francesco
Novel computational strategies for the identification of new therapeutic targets in melanoma and thyroid cancer. 20-nov-2018 Russo, Giulia
Design and optimization of PEGylated nanoparticles intended for Berberine Chloride delivery 1-gen-2019 Musumeci, Teresa; Bonaccorso, Angela; Carbone, Claudia; Russo, Giulia; Pappalardo, Francesco; Puglisi, Giovanni
((2S)-N-2-methoxy-2-phenylethyl-6,7-benzomorphan compound (2S-LP2): Discovery of a biased mu/delta opioid receptor agonist 1-gen-2019 Pasquinucci, Lorella; Turnaturi, Rita; Calò, Girolamo; Pappalardo, Francesco; Ferrari, Federica; Russo, Giulia; Arena, Emanuela; Montenegro, Lucia; Chiechio, Santina; Prezzavento, Orazio; Parenti, Carmela
Generation of digital patients for the simulation of tuberculosis with UISS-TB 1-gen-2019 Pennisi, Marzio; Juarez, Miguel A.; Russo, Giulia; Viceconti, Marco; Pappalardo, Francesco
Toward computational modelling on immune system function 1-gen-2019 Pappalardo, Francesco; Pennisi, Marzio; Reche, Pedro A; Russo, Giulia
Gene expression and pathway bioinformatics analysis detect a potential predictive value of MAP3K8 in thyroid cancer progression 1-gen-2019 Di Salvatore, Valentina; Giani, Fiorenza; Russo, Giulia; Pennisi, Marzio; Malandrino, Pasqualino; Frasca, Francesco; Pappalardo, Francesco
Evaluation of the efficacy of RUTI and ID93/GLA-SE vaccines in tuberculosis treatment: in silico trial through UISS-TB simulator 1-gen-2019 Russo, Giulia; Pappalardo, Francesco; Juarez, Miguel A.; Pennisi, Marzio; Cardona, Pere Joan; Coler, Rhea; Fichera, Epifanio; Viceconti, Marco
In silico clinical trials: concepts and early adoptions 1-gen-2019 Pappalardo, Francesco; Russo, Giulia; Tshinanu, Flora Musuamba; Viceconti, Marco
A MapReduce Based Tool for the Analysis and Discovery of Novel Therapeutic Targets 1-gen-2019 Parasiliti, Giuseppe; Pennisi, Marzio; Biondi, Pietro; Sgroi, Giuseppe; Russo, Giulia; Napoli, Christian; Pappalardo, Francesco
EpiMethEx: a tool for large-scale integrated analysis in methylation hotspots linked to genetic regulation 1-gen-2019 Candido, S; PARASILITI PALUMBO, GIUSEPPE ALESSANDRO; Pennisi, M; Russo, G; Sgroi, G; DI SALVATORE, Valentina; Libra, M; Pappalardo, F
A MapReduce tool for in-depth analysis of KEGG pathways: identification and visualization of therapeutic target candidates 1-gen-2019 Palumbo, Giuseppe Alessandro Parasiliti; Biondi, Pietro; Sgroi, Giuseppe; Pennisi, Marzio; Russo, Giulia; Pappalardo, Francesco
GPU accelerated analysis of treg-teff cross regulation in relapsing-remitting multiple sclerosis 1-gen-2019 Beccuti, Marco; Cazzaniga, Paolo; Pennisi, Marzio; Besozzi, Daniela; Nobile, Marco S.; Pernice, Simone; Russo, Giulia; Tangherloni, Andrea; Pappalardo, Francesco
Computational modeling reveals MAP3K8 as mediator of resistance to vemurafenib in thyroid cancer stem cells 1-gen-2019 Gianì, Fiorenza; Russo, Giulia; Pennisi, Marzio; Sciacca, Laura; Frasca, Francesco; Pappalardo, Francesco
Predicting the artificial immunity induced by RUTI® vaccine against tuberculosis using universal immune system simulator (UISS) 1-gen-2019 Pennisi, Marzio; Russo, Giulia; Sgroi, Giuseppe; Bonaccorso, Angela; Parasiliti Palumbo, Giuseppe Alessandro; Fichera, Epifanio; Mitra, Dipendra Kumar; Walker, Kenneth B; Cardona, Pere-Joan; Amat, Merce; Viceconti, Marco; Pappalardo, Francesco
Exploiting Stochastic Petri Net formalism to capture the Relapsing Remitting Multiple Sclerosis variability under Daclizumab administration 1-gen-2019 Pernice, Simone; Romano, Greta; Russo, Giulia; Beccuti, Marco; Pennisi, Marzio; Pappalardo, Francesco
Computational modeling approach to suggest possible therapeutic interventions in spinal muscular atrophy 1-gen-2019 Russo, G.; Zhang, G. file da validare
Computational modeling of immunologic response to immune checkpoint inhibitors in COVID-19 patients with and without cancer 1-gen-2020 Russo, Giulia; Falzone, Luca; Cacopardo, Bruno Santi; Nunnari, Giuseppe; Francesco, Torino; Scandurra, Giuseppa; Stefani, Stefania; Pappalardo, Francesco; Libra, Massimo file da validare
PETAL: A Python tool for deep analysis of biological pathways 1-gen-2020 Sgroi, G.; Russo, G.; Pappalardo, F.
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